Trung tâm Kiểm định và Kiểm nghiệm Đồng Tháp đã xây dựng hệ thống quản lý chất lượng và được các Bộ ngành công nhận, chỉ định:
1. Tổng cục Tiêu chuẩn Đo lường Chất lượng – Bộ Khoa học và Công nghệ cấp Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động thử nghiệm (theo Nghị định 107/2016/NĐ-CP)
2. Văn phòng Công nhận Chất lượng – Bộ Khoa học và Công nghệ công nhận phòng thí nghiệm phù hợp theo ISO/IEC 17025:2017 (VILAS 260)
3. Cục Bảo vệ Thực vật – Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn cấp Giấy chưng nhận đăng ký hoạt động thử nghiệm lĩnh vực phân bón (theo Nghị định 107/2016/NĐ-CP)
4. Cục An toàn thực phẩm – Bộ Y tế chỉ định thực hiện kiểm nghiệm thực phẩm phục vụ công tác quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm (19/2019/BYT-KNTP)
5. Tổng Cục môi trường – Bộ Tài nguyên và Môi trường cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện hoạt động dịch vụ quan trắc môi trường (VIMCERTS 194)